Publié le : novembre 7, 2024

La découverte de médicaments axés sur des classes de cibles a fait ses preuves dans la recherche pharmaceutique, mais les données du domaine public indiquent que de nombreux membres de familles de protéines ne sont pas ligandés. Nous présentons ici une approche systématique visant à intensifier la découverte et la caractérisation de ligands de petites molécules pour la famille de protéines répétées WD40 (WDR). Nous avons mis au point une série complète de protocoles pour la production de protéines, la cristallographie et les essais biophysiques, biochimiques et cellulaires. Une campagne pilote de recherche de résultats utilisant la sélection de chimiothèques codées par l'ADN suivie d'un apprentissage automatique (DEL-ML) pour prédire les ligands à partir de bibliothèques virtuelles a permis d'obtenir des ligands de type médicament pour 7 des 16 domaines WDR examinés, démontrant ainsi la plus grande capacité de ligandage des WDR. Cette étude établit un modèle pour l'évaluation de la ligandabilité de l'ensemble de la famille de protéines et fournit une ressource étendue d'outils biochimiques et chimiques, de connaissances et de protocoles sur les protéines WDR afin de découvrir des traitements potentiels pour cette classe de cibles très importante pour la maladie, mais sous-explorée.

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